Thực phẩm chức năng có được giảm thuế GTGT không đang là vấn đề được nhiều doanh nghiệp sản xuất và kinh doanh sản phẩm này quan tâm, đặc biệt trong bối cảnh chi phí vận hành ngày càng tăng cao. Việc áp dụng đúng chính sách thuế không chỉ giúp tối ưu hóa lợi nhuận mà còn tránh các rủi ro pháp lý không đáng có. Do đó, việc cập nhật thông tin mới nhất là rất cần thiết để doanh nghiệp hoạt động hiệu quả. Cùng ACC Vũng Tàu khám phá chi tiết qua bài viết dưới đây.
1. Thực phẩm chức năng có được giảm thuế GTGT không?
Thực phẩm chức năng, hay còn gọi là thực phẩm bổ sung dinh dưỡng, là những sản phẩm hỗ trợ sức khỏe con người nhưng không phải là thuốc chữa bệnh. Theo quy định tại Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, các sản phẩm này thuộc đối tượng chịu thuế GTGT với mức thuế suất 10%, vì chúng được coi là hàng hóa thông thường không nằm trong danh mục không chịu thuế.
Cụ thể, Luật này liệt kê các đối tượng không chịu thuế như thuốc chữa bệnh cho người và động vật, nhưng thực phẩm chức năng không được xếp vào nhóm này do tính chất bổ trợ chứ không phải điều trị. Do đó, thực phẩm chức năng có được giảm thuế GTGT không thường nhận câu trả lời là không, trừ khi có chính sách tạm thời từ Chính phủ. Nghị định số 181/2025/NĐ-CP quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng đã làm rõ hơn về các trường hợp miễn thuế, nhưng thực phẩm chức năng vẫn phải chịu thuế đầy đủ trừ khi thuộc diện xuất khẩu hoặc các ưu đãi đặc biệt.
Trong những năm gần đây, mặc dù có một số đề xuất giảm thuế cho lĩnh vực y tế và dinh dưỡng, nhưng đến nay, không có quy định mới nào thay đổi cơ bản vị trí của thực phẩm chức năng. Ví dụ, trong bối cảnh kinh tế hậu đại dịch, Chính phủ có thể ban hành các nghị quyết tạm thời giảm thuế GTGT cho một số mặt hàng thiết yếu, nhưng thực phẩm chức năng thường không được ưu tiên vì chúng không phải nhu yếu phẩm cơ bản. Doanh nghiệp cần theo dõi sát sao các thông tư hướng dẫn từ Bộ Tài chính để tránh nhầm lẫn.
Việc hiểu rõ điều này giúp các nhà sản xuất lập kế hoạch tài chính chính xác, tránh tình trạng kê khai sai dẫn đến phạt hành chính. Hơn nữa, nếu sản phẩm được chứng nhận là thực phẩm bảo vệ sức khỏe theo quy định của Bộ Y tế, điều đó không tự động dẫn đến giảm thuế mà chỉ hỗ trợ trong khâu đăng ký lưu hành. Tóm lại, thực phẩm chức năng có được giảm thuế GTGT không vẫn là câu hỏi cần xem xét theo từng trường hợp cụ thể, nhưng pháp luật hiện hành nghiêng về việc áp dụng thuế suất chuẩn 10%.
2. Đặc điểm phân loại và ảnh hưởng đến chính sách thuế GTGT cho thực phẩm chức năng
Thực phẩm chức năng được phân loại theo các tiêu chí cụ thể dựa trên thành phần và công dụng, điều này trực tiếp ảnh hưởng đến việc áp dụng thuế GTGT. Theo Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, các sản phẩm này thường được coi là hàng hóa chịu thuế vì chúng không đáp ứng điều kiện của đối tượng không chịu thuế tại Điều 5, chẳng hạn như không phải là sản phẩm y tế chuyên dụng.
Nghị định số 181/2025/NĐ-CP bổ sung chi tiết rằng, nếu thực phẩm chức năng chứa các hoạt chất giống thuốc thì có thể được xem xét miễn thuế, nhưng thực tế hiếm khi xảy ra vì chúng phải được cơ quan chức năng phân loại rõ ràng. Ví dụ, các sản phẩm như vitamin tổng hợp hoặc thực phẩm bổ sung collagen thường chịu thuế 10% vì được bán rộng rãi trên thị trường như hàng tiêu dùng. Sự khác biệt này giúp phân biệt với thuốc kê đơn, vốn được miễn thuế để hỗ trợ chăm sóc sức khỏe cộng đồng. Doanh nghiệp kinh doanh thực phẩm chức năng cần chú ý đến mã HS (Harmonized System) khi kê khai hải quan hoặc thuế, vì mã này quyết định mức thuế áp dụng.
Trong thực tế, nhiều công ty nhập khẩu sản phẩm từ nước ngoài thường gặp khó khăn khi tính toán thuế GTGT đầu vào và đầu ra, dẫn đến chi phí tăng cao nếu không khấu trừ đúng cách. Hơn nữa, nếu sản phẩm được quảng cáo sai lệch như "thuốc chữa bệnh", cơ quan thuế có thể áp dụng các biện pháp xử phạt nghiêm ngặt theo quy định tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP. Việc nắm bắt đặc điểm này không chỉ giúp tuân thủ pháp luật mà còn hỗ trợ chiến lược định giá sản phẩm cạnh tranh.
Tổng thể, thực phẩm chức năng có được giảm thuế GTGT không phụ thuộc lớn vào cách phân loại chính xác, và doanh nghiệp nên tham khảo ý kiến chuyên gia để tránh rủi ro.
Xem thêm: Có bắt buộc phải kê khai giá thực phẩm chức năng không?
3. Các trường hợp đặc biệt có thể áp dụng giảm hoặc miễn thuế GTGT cho thực phẩm chức năng
Mặc dù thực phẩm chức năng thường chịu thuế GTGT đầy đủ, nhưng có một số trường hợp đặc biệt mà doanh nghiệp có thể được hưởng ưu đãi theo quy định pháp luật. Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 tại Điều 9 quy định về thuế suất 0% cho hàng hóa xuất khẩu, do đó nếu thực phẩm chức năng được xuất khẩu ra nước ngoài, doanh nghiệp có thể được hoàn thuế GTGT đầu vào mà không phải nộp thuế đầu ra.
Nghị định số 181/2025/NĐ-CP hướng dẫn chi tiết tại Điều 23 rằng, các sản phẩm thuộc diện ưu đãi đầu tư theo Luật Đầu tư có thể được miễn thuế trong một số năm đầu, nhưng điều này áp dụng cho dự án sản xuất chứ không phải từng sản phẩm riêng lẻ. Ví dụ, nếu doanh nghiệp đầu tư vào nhà máy sản xuất thực phẩm chức năng tại khu công nghiệp ưu đãi, họ có thể được giảm thuế GTGT theo chính sách địa phương.
Ngoài ra, trong các chương trình hỗ trợ y tế cộng đồng, như phân phối miễn phí cho vùng sâu vùng xa, sản phẩm có thể được miễn thuế theo quyết định của cơ quan nhà nước có thẩm quyền. Tuy nhiên, những trường hợp này đòi hỏi hồ sơ chứng minh rõ ràng, bao gồm giấy chứng nhận xuất khẩu hoặc quyết định ưu đãi từ Bộ Tài chính. Doanh nghiệp cần chuẩn bị đầy đủ để tránh tình trạng bị từ chối hoàn thuế.
Một lưu ý quan trọng là, nếu thực phẩm chức năng được sử dụng trong các chương trình từ thiện được phê duyệt, Nghị định 181/2025/NĐ-CP cho phép miễn thuế GTGT cho phần giá trị tương ứng. Những ưu đãi này giúp giảm gánh nặng tài chính, đặc biệt với các doanh nghiệp nhỏ và vừa. Tóm lại, mặc dù việc thực phẩm chức năng được giảm thuế GTGT không phổ biến, nhưng các trường hợp đặc biệt vẫn tồn tại và cần được khai thác đúng cách để tối ưu hóa lợi ích.
Xem thêm: Thủ tục xin giấy phép kinh doanh thực phẩm chức năng chi tiết
4. Quy trình kê khai và nộp thuế GTGT đối với thực phẩm chức năng
Để đảm bảo tuân thủ, doanh nghiệp kinh doanh thực phẩm chức năng cần nắm rõ quy trình kê khai thuế GTGT theo quy định pháp luật. Quy trình này được hướng dẫn chi tiết trong Nghị định số 181/2025/NĐ-CP, giúp tránh sai sót và tối ưu hóa khấu trừ. Dưới đây là các bước cơ bản:
Bước 1: Đăng ký mã số thuế và phân loại sản phẩm
Doanh nghiệp phải đăng ký mã số thuế tại cơ quan thuế địa phương và xác định rõ mã HS cho thực phẩm chức năng để áp dụng thuế suất 10% theo Luật Thuế giá trị gia tăng 2024. Việc phân loại đúng giúp tránh nhầm lẫn với các sản phẩm miễn thuế, đồng thời chuẩn bị cơ sở cho việc kê khai hàng tháng hoặc quý. Nếu sản phẩm nhập khẩu, cần kèm theo giấy chứng nhận nguồn gốc để hỗ trợ khấu trừ thuế đầu vào. Quy trình này thường mất từ 3-7 ngày làm việc và là nền tảng cho các bước sau.
Bước 2: Theo dõi và ghi chép hóa đơn, chứng từ
Doanh nghiệp cần ghi nhận đầy đủ hóa đơn GTGT đầu vào từ nhà cung cấp và đầu ra khi bán hàng, theoNghị định 181/2025/NĐ-CP. Các chứng từ phải lưu trữ ít nhất 10 năm để phục vụ kiểm tra. Trong trường hợp khấu trừ, chỉ những hóa đơn hợp lệ mới được chấp nhận, giúp giảm số thuế phải nộp thực tế. Bước này đòi hỏi sử dụng phần mềm kế toán để theo dõi chính xác, tránh tình trạng kê khai sai dẫn đến phạt từ 20-100% số thuế thiếu.
Bước 3: Kê khai và nộp tờ khai thuế GTGT
Hàng tháng hoặc quý, doanh nghiệp nộp tờ khai thuế GTGT qua hệ thống điện tử theo hướng dẫn của Tổng cục Thuế, dựa trên Luật Thuế giá trị gia tăng 2024. Tờ khai phải tính toán chính xác thuế đầu ra trừ đầu vào, và nếu có số âm thì được hoàn thuế. Quy trình nộp thường kết thúc trước ngày 20 của tháng sau, với các trường hợp đặc biệt như xuất khẩu cần nộp riêng. Việc thực hiện đúng giúp doanh nghiệp duy trì uy tín và tránh kiểm tra đột xuất.
Bước 4: Kiểm tra và điều chỉnh nếu có sai sót
Sau khi nộp, nếu phát hiện sai sót, doanh nghiệp có thể điều chỉnh theo quy định tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP bằng cách nộp bổ sung kèm giải trình. Cơ quan thuế sẽ kiểm tra trong vòng 30 ngày và thông báo kết quả. Bước này đảm bảo tính minh bạch và giúp doanh nghiệp học hỏi từ lỗi để cải thiện. Tổng thể, quy trình này không chỉ tuân thủ pháp luật mà còn hỗ trợ quản lý tài chính hiệu quả cho hoạt động kinh doanh thực phẩm chức năng.
5. Câu hỏi thường gặp
Thực phẩm chức năng nhập khẩu có được khấu trừ thuế GTGT đầu vào không?
Có, theo Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 và Nghị định số 181/2025/NĐ-CP, thuế GTGT đầu vào từ hàng nhập khẩu thực phẩm chức năng được khấu trừ nếu có hóa đơn hợp lệ và chứng từ thanh toán. Tuy nhiên, nếu sản phẩm không đạt chuẩn an toàn thực phẩm, cơ quan thuế có thể từ chối khấu trừ để bảo vệ lợi ích công cộng.
Làm thế nào để phân biệt thực phẩm chức năng với thuốc chữa bệnh về thuế GTGT?
Phân biệt dựa trên giấy chứng nhận từ Bộ Y tế, theo quy định tại Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, nơi thuốc chữa bệnh được miễn thuế còn thực phẩm chức năng chịu 10%. Nghị định 181/2025/NĐ-CP hướng dẫn rằng, nếu sản phẩm chỉ bổ trợ dinh dưỡng mà không điều trị bệnh cụ thể, nó sẽ chịu thuế đầy đủ. Doanh nghiệp nên kiểm tra nhãn mác và đăng ký để tránh tranh chấp với cơ quan thuế.
Có chính sách giảm thuế GTGT tạm thời cho thực phẩm chức năng trong đại dịch không?
Trong một số giai đoạn, Chính phủ có thể ban hành nghị quyết giảm thuế GTGT cho lĩnh vực sức khỏe, nhưng theo Nghị định 181/2025/NĐ-CP, thực phẩm chức năng thường không được ưu tiên trừ khi thuộc chương trình hỗ trợ cụ thể. Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 cho phép điều chỉnh tạm thời, nhưng doanh nghiệp cần theo dõi thông báo từ Bộ Tài chính để áp dụng đúng, tránh tình trạng kê khai sai dẫn đến phạt.
Thực phẩm chức năng có được giảm thuế GTGT không là vấn đề cần được làm rõ dựa trên quy định pháp luật hiện hành để doanh nghiệp tránh rủi ro và tối ưu hóa chi phí. Việc áp dụng đúng các quy định từ Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 và Nghị định số 181/2025/NĐ-CP không chỉ đảm bảo tuân thủ mà còn hỗ trợ phát triển bền vững. Nếu bạn đang gặp khó khăn trong việc kê khai hoặc tư vấn thuế, hãy liên hệ ACC Vũng Tàu để nhận hỗ trợ chuyên sâu và kịp thời ngay hôm nay.
Để lại một bình luận